1943年2月，德国纳粹政府宣布首都柏林已经清除了犹太人。此时此刻，有7000名犹太人成功转入地下生活。而最终只有近1700名犹太人在战时柏林的恐怖氛围中成为幸存者。影片《隐形同盟》讲述了四位至今仍健在的历史见证者的这段经历。电影巧妙地将他们的真实采访与戏剧形式的影像结合，还原了那段重要历史时刻。残忍的驱逐在纳粹秘密警察的监督下继续，西莫在驱逐中心被分配到用工处，之后棒地下秘密反战者制造制作身份证件，但他的父母却被送往集中营遇害。战争快结束时，西莫从德国骑车穿行到瑞士定居。欧根的犹太人母亲嫁给了德国嫉妒免于驱逐，但欧根却只能躲藏，最后在一家反战地下组织的头目家住下，目睹了这些反战人士为了犹太人的自由和人权努力抗争的过程。吕特一家失去了躲避的住所，四散在城中，她被一个善良的德国军官收留帮忙家务和照顾小孩，直到战争结束找回亲人。收养孤儿汉尼的家庭被揭发了，汉尼染了金发掩盖她的犹太血统，独自在城中逃亡，露宿街头的她只得时常去看电影，后来被好心的售票员收留保护，战争结束后被亲戚带到巴黎生活。